Письмо Минфина России от 15.07.2010 N 03-04-06/3-148
По мнению Минфина, организация не вправе заключить с физическим лицом, которому она выплачивает доход за оказание услуг (в частности, арендную плату), соглашение об уплате НДФЛ самим гражданином. Такое соглашение будет являться ничтожным. Ведь организация как налоговый агент обязана сама исчислить, удержать и перечислить в бюджет налог с выплат этому лицу.
Разумеется, по таким доходам именно организация признается налоговым агентом. И только если она не смогла удержать НДФЛ (например, доход выплачен в натуральной форме), то обязанность по его уплате перекладывается на гражданина.
А если уж организации так не хочется связываться с удержанием НДФЛ, то она может предложить арендодателю зарегистрироваться в качестве индивидуального предпринимателя. Тогда именно он будет обязан сам уплачивать налоги (и взносы) со своих доходов. А если арендодатель станет еще и упрощенцем, то сможет существенно сэкономить на налогах.