В случае когда в течение года компания или ее "обособка" сменила место нахождения, из-за чего была снята с регистрации в одной ИФНС и поставлена на учет в другой, расчет по форме 6-НДФЛ, а также справки 2-НДФЛ сдавать нужно уже в новую инспекцию.
Письмо ФНС России от 27.12.2016 N БС-4-11/25114@
В 2-НДФЛ и в 6-НДФЛ, представляемых за период, когда организация (или ОП) стояла на учете по старому адресу, нужно указать код ОКТМО по прежнему месту нахождения. А отчитываясь за период после постановки на учет в новой ИФНС, нужно указать код ОКТМО по новому адресу. И в обоих случаях следует указать КПП, присвоенный организации (ОП) уже по новому месту прописки.
Письмо ФНС России от 27.12.2016 N БС-4-11/25114@
В 2-НДФЛ и в 6-НДФЛ, представляемых за период, когда организация (или ОП) стояла на учете по старому адресу, нужно указать код ОКТМО по прежнему месту нахождения. А отчитываясь за период после постановки на учет в новой ИФНС, нужно указать код ОКТМО по новому адресу. И в обоих случаях следует указать КПП, присвоенный организации (ОП) уже по новому месту прописки.