Поставить точку в ликвидации юрлица до окончания выездной проверки нельзя

Хотя бы потому, что, пока решение по результатам проверки не вступило в законную силу, представить в ИФНС ликвидационный баланс невозможно.
Решение ФНС России от 14.07.2015 б/н

Налоговая служба рассмотрела жалобу юрлица о неправомерности отказа в госрегистрации в связи с ликвидацией по причине непредставления ликвидационного баланса. Налогоплательщик утверждал, что все необходимые для завершения процесса ликвидации документы (Пункт 1 ст. 21 Закона от 08.08.2001 N 129-ФЗ) были представлены в ИФНС. Однако налоговики оставили жалобу без удовлетворения, указав на то, что как на момент представления документации, так и на момент вынесения решения об отказе итоговый документ по результатам выездной проверки в отношении ликвидируемой организации еще не вступил в силу. А по нормам Закона N 129-ФЗ до этого дня организация не может представить уведомление о составлении промежуточного ликвидационного баланса (Пункт 4 ст. 20 Закона N 129-ФЗ). И следовательно, переданная в пакете ликвидационных документов бухгалтерская (финансовая) отчетность считаться ликвидационным балансом никак не может.