Письмо ФНС России от 10.03.2011 N КЕ-4-3/3790
ФНС настаивает на выставлении счетов-фактур на все полученные авансы. Даже на те, отгрузка по которым произойдет в течение 5 последующих дней. ФНС при этом ссылается на букву закона: в соответствии с НК РФ налоговую базу по НДС нужно определять и при получении аванса, и при отгрузке (Пункты 1, 14 ст. 167 НК РФ). А значит, надо и счета-фактуры составлять тоже дважды, а по авансовому счету-фактуре начислять налог и тут же принимать его к вычету после отгрузки (Пункт 8 ст. 171, п. 6 ст. 172 НК РФ; п. 13 Правил, утв. Постановлением Правительства РФ от 02.12.2000 N 914).
Разумеется, бухгалтерам не выгодно "плодить" лишний документооборот, если отгрузки в счет авансов происходят в пределах одного квартала, а тем более в течение 5 дней, которые НК РФ отводит на составление счета-фактуры. И Минфин давно вошел в их положение: в таких случаях он разрешает не составлять счет-фактуру на аванс и не отражать дважды налоговую базу (Письмо Минфина России от 06.03.2009 N 03-07-15/39). Достаточно сделать это по результатам отгрузки, если, конечно, суммовые показатели аванса и отгрузки совпадают.
Почему упорствует ФНС, не совсем понятно. Но в любом случае учтите, что несоставление счетов-фактур на авансы и неотражение оборотов по НДС с авансов в таких случаях (если поставка идет в течение 5 дней и внутри квартала) не грозят вам какими-либо доначислениями. Правда, вы рискуете при проверке получить внушительный штраф по ст. 120 НК РФ за отсутствие налоговой первички (10 тыс. руб., если нарушение - только в одном квартале, и 30 тыс. руб., если нарушение повторяется несколько кварталов).